Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ME1P48163 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ME1P48163 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ME1P48163 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms