Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBRP36941 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBRP36941 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBRP36941 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBRP36941 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBRP36941 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBRP36941 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBRP36941 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBRP36941 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBRP36941 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBRP36941 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBRP36941 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBRP36941 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBRP36941 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBRP36941 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBRP36941 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBRP36941 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBRP36941 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms