Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN7P35236 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms