Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJA4P35212 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GJA4P35212 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJA4P35212 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms