Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIP1P30622 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms