Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD38P28907 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD38P28907 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD38P28907 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD38P28907 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD38P28907 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD38P28907 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD38P28907 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD38P28907 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD38P28907 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD38P28907 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD38P28907 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD38P28907 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms