Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD27P26842 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms