Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTX3P26022 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms