Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms