Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms