Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
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