Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK11BP21127 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms