Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPN3P20807 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms