Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms