Protein–RNA interactions for Protein: P19484

TFEB, Transcription factor EB, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFEBP19484 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFEBP19484 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFEBP19484 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFEBP19484 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFEBP19484 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFEBP19484 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFEBP19484 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFEBP19484 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFEBP19484 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TFEBP19484 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFEBP19484 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFEBP19484 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFEBP19484 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFEBP19484 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFEBP19484 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TFEBP19484 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms