Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms