Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXB9P17482 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms