Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NME1P15531 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NME1P15531 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NME1P15531 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NME1P15531 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NME1P15531 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NME1P15531 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NME1P15531 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NME1P15531 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NME1P15531 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NME1P15531 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NME1P15531 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NME1P15531 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NME1P15531 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NME1P15531 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NME1P15531 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NME1P15531 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NME1P15531 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NME1P15531 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NME1P15531 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NME1P15531 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NME1P15531 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NME1P15531 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NME1P15531 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NME1P15531 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NME1P15531 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NME1P15531 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NME1P15531 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NME1P15531 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NME1P15531 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NME1P15531 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NME1P15531 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NME1P15531 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NME1P15531 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NME1P15531 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NME1P15531 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NME1P15531 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME1P15531 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms