Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRF1P14222 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRF1P14222 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms