Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms