Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPRP12270 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPRP12270 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPRP12270 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPRP12270 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPRP12270 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPRP12270 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPRP12270 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPRP12270 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPRP12270 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPRP12270 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPRP12270 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPRP12270 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPRP12270 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRP12270 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRP12270 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRP12270 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRP12270 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRP12270 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRP12270 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRP12270 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRP12270 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRP12270 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRP12270 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRP12270 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRP12270 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRP12270 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRP12270 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRP12270 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRP12270 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRP12270 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRP12270 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRP12270 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRP12270 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRP12270 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRP12270 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRP12270 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRP12270 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRP12270 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRP12270 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRP12270 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPRP12270 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TPRP12270 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TPRP12270 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TPRP12270 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TPRP12270 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TPRP12270 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TPRP12270 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TPRP12270 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TPRP12270 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TPRP12270 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TPRP12270 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TPRP12270 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
TPRP12270 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TPRP12270 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TPRP12270 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TPRP12270 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TPRP12270 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TPRP12270 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TPRP12270 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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