Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms