Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB7P09629 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms