Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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PKHD1P08F94 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PKHD1P08F94 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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