Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA4P06727 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA4P06727 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA4P06727 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA4P06727 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOA4P06727 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
APOA4P06727 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
APOA4P06727 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.18
APOA4P06727 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOA4P06727 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOA4P06727 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA4P06727 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA4P06727 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOA4P06727 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms