Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX4O95219 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX4O95219 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX4O95219 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX4O95219 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX4O95219 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX4O95219 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX4O95219 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX4O95219 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX4O95219 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX4O95219 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX4O95219 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX4O95219 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX4O95219 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX4O95219 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX4O95219 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX4O95219 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX4O95219 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX4O95219 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX4O95219 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX4O95219 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX4O95219 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX4O95219 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX4O95219 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX4O95219 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms