Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHP4O75161 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms