Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms