Protein–RNA interactions for Protein: O60609

GFRA3, GDNF family receptor alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3O60609 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA3O60609 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms