Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRICKLE3O43900 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms