Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNPHO15079 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNPHO15079 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNPHO15079 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNPHO15079 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNPHO15079 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNPHO15079 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNPHO15079 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNPHO15079 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SNPHO15079 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNPHO15079 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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