Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms