Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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USP17L12C9JPN9 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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USP17L12C9JPN9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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USP17L12C9JPN9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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USP17L12C9JPN9 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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USP17L12C9JPN9 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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USP17L12C9JPN9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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USP17L12C9JPN9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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