Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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