Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XIRP2A4UGR9 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms