Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAXBP1Q9Y5B6 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAXBP1Q9Y5B6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAXBP1Q9Y5B6 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAXBP1Q9Y5B6 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAXBP1Q9Y5B6 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAXBP1Q9Y5B6 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAXBP1Q9Y5B6 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAXBP1Q9Y5B6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAXBP1Q9Y5B6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAXBP1Q9Y5B6 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAXBP1Q9Y5B6 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAXBP1Q9Y5B6 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAXBP1Q9Y5B6 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAXBP1Q9Y5B6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PAXBP1Q9Y5B6 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAXBP1Q9Y5B6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAXBP1Q9Y5B6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAXBP1Q9Y5B6 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAXBP1Q9Y5B6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAXBP1Q9Y5B6 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAXBP1Q9Y5B6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAXBP1Q9Y5B6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAXBP1Q9Y5B6 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAXBP1Q9Y5B6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAXBP1Q9Y5B6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAXBP1Q9Y5B6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms