Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHKBQ9Y259 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHKBQ9Y259 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHKBQ9Y259 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHKBQ9Y259 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHKBQ9Y259 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHKBQ9Y259 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHKBQ9Y259 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms