Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
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RABGEF1Q9UJ41 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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RABGEF1Q9UJ41 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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RABGEF1Q9UJ41 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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RABGEF1Q9UJ41 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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RABGEF1Q9UJ41 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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RABGEF1Q9UJ41 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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RABGEF1Q9UJ41 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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RABGEF1Q9UJ41 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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