Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms