Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms