Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DKK2Q9UBU2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms