Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLA2Q9P2R7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms