Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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