Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNAJC28Q9NX36 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms