Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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