Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMURF2Q9HAU4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMURF2Q9HAU4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms