Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms