Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms