Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms