Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms